|
| |
Колонки Clarity Oligo-RP специально разработаны для обращённо-фазовой очистки олигонуклеотидов с соблюдением баланса между гидрофобностью и полярной селективностью. Частицы сорбента выполнены по композитной TWIN™ технологии. Эта технология даёт лучшую селективность и эффективность при работе с олигонуклеотидами по сравнению с другими имеющимися на рынке гибридными и полимерными сорбентами или сорбентами на основе силикагеля. Колонки Clarity Oligo-RP выпускаются в широком диапазоне размеров с частицами сорбента 3, 5 и 10 мкм.
- Отделение до 90% ошибочных N-1 цепочек от целевого олигонуклеотида.
- Очистка не защищённых тритильной группой ДНК, РНК, тиоатов и модифицированных/меченных олигонуклеотидов.
- Препаративные колонки для загрузки > 5 мкмоль.
- Очистка олигонуклеотидов длиной до 60 оснований.
- Отличные колонки для задач контроля качества методом обращённо-фазовой ВЭЖХ.
Сорбент Oligo-RP специально разработан так, чтобы совместить все возможные способы нуклеотидов взаимодействовать друг с другом. Сорбент обладает гидрофобной, дипольной, п-п и водородной связью донорно-акцепторных участков. Благодаря этой комбинаций взаимодействий и ион-парному реагенту достигается высокий уровень избирательной селективности между нуклеиновыми кислотами. Oligo-RP может распознать даже незначительные изменения в цепочке нуклеотидов, например, разницу в одно основание (N и N-1) или замену одного основания другим.
Разделение ошибочной цепочки длины N-1 и целевой цепочки длины N
 |
Образцы: 1. Цепочка РНК из 20 оснований: CUGUAAUCUCUUGUCUATT 2. Цепочка РНК из 21 основания: UCUGUAAUCUCUUGUCUATT |
Колонка: |
Clarity Oligo-RP C18 50х4.6 мм 3 мкм |
Подвижная фаза: |
A: 10 мМ гексафторизопропанол; B: метанол |
Градиент: |
c A/B (75:25) до A/B (55:45) за 80 мин |
Расход: |
1 мл/мин |
Детектирование: |
УФ 260 нм |
Разрешение примесей в цепочке ДНК из 60 оснований
 |
Образец: Цепочка ДНК из 60 оснований: 5’-CTC CTG GGC CGT GGC TCT GCG CAC TTC AGG AAA CTG GGC ACT CCT GGG CAG TGG ATC TGC-3’ Номера пиков обозначают длину цепочки присутствующей примеси |
Колонка: |
Clarity Oligo-RP C18 50х4.6 мм 3 мкм |
Подвижная фаза: |
A: 50 мМ триэтиламмоний ацетат pH 7.5/5% ацетонитрил; B: метанол |
Градиент: |
с 20% до 25% B за 20 мин; держать 25% В - 5 мин |
Расход: |
1 мл/мин |
Детектирование: |
УФ 260 нм |
Обращённо-фазовое разделение олигонуклеотидов имеет преимущество перед другими методами разделения, такими как ионный обмен. Фаза Oligo-RP предусматривает высокую нагрузочную способность и обеспечивает высокую степень восстановления и чистоты, устраняя необходимость в дополнительных стадиях очистки, таких как обессоливание. Так как обращенно-фазовая ВЭЖХ обладает чрезвычайно высоким разрешением, колонки Oligo-RP позволяют легко отделить целевой олигонуклеотид от многих примесей, таких как N-1 ошибочные цепочки. Кроме того, с помощью одной колонки можно разделять и ДНК, и РНК, и модифицированные олигонуклеотиды.
Препаративная очистка ДНК
 |
Колонка: |
Clarity Oligo-RP C18 3 мкм 50х10 мм (препаративная) 50х4.6 мм (аналитическая) |
Подвижная фаза: |
A: 50 мМ триэтиламмоний ацетат pH 7.5/5% ацетонитрил; B: метанол |
Градиент: |
с A/B (90:10) до A/B (40:60) за 20 мин |
Расход: |
1 мл/мин |
Детектирование: |
УФ 260 нм |
Образец: |
цепочка ДНК из 20 оснований ACGTCATGTCGAGATCATCG | |
200 мкг (1 мкмоль) образца 20-мерной ДНК были загружены в препаративную колонку Clarity Oligo-RP с внутренним диаметром 10 мм. В результате примеси были удалены из целевой цепочки. |
 |
Для проверки качества препаративной очистки был проведён анализ на аналитической колонке. Подтверждена степень очистки 92% при выходе 85%. |
Очистка меченных ДНК с различным содержание GC
 |
Образцы: 1. FAM-меченная ДНК (25 оснований) GC: 72% 2. FAM-меченная ДНК (25 оснований) GC: 56% 3. FAM-меченная ДНК (25 оснований) GC: 20%
|
Колонка: |
Clarity Oligo-RP C18 50х4.6 мм 3 мкм |
Подвижная фаза: |
A: 50 мМ триэтиламмоний ацетат pH 7.5/5% ацетонитрил; B: метанол |
Градиент: |
с A/B (90:10) до A/B (40:60) за 20 мин |
Расход: |
1 мл/мин |
Детектирование: |
УФ 260 нм |
Информация для заказа Колонки малого диаметра
Номер по каталогу Phenomenex |
Зернение, мкм |
Размер колонки, мм (длина х диаметр) |
00B-4441-B0 |
3 |
50x2,0 |
00D-4441-B0 |
3 |
100x2,0 |
00F-4441-B0 |
3 |
150x2,0 |
00F-4442-B0 |
5 |
150x2,0 | Аналитические колонки
Номер по каталогу Phenomenex |
Зернение, мкм |
Размер колонки, мм (длина х диаметр) |
00B-4441-E0 |
3 |
50x4,6 |
00D-4441-E0 |
3 |
100х4,6 |
00F-4441-E0 |
3 |
150х4,6 |
00B-4442-E0 |
5 |
50x4,6 |
00F-4442-E0 |
5 |
150x4,6 |
00G-4442-E0 |
5 |
250x4,6 |
00F-4445-E0 |
10 |
150х4,6 | Полупрепаративные и препаративные колонки
Номер по каталогу Phenomenex |
Зернение, мкм |
Размер колонки, мм (длина х диаметр) |
00B-4441-N0 |
3 |
50x10 |
00B-4442-N0 |
5 |
50x10 |
00D-4442-N0 |
5 |
100x10 |
00F-4442-N0 |
5 |
150x10 |
00G-4442-N0 |
5 |
250х10 |
00D-4442-P0-AX |
5 |
100х21.2 |
00G-4442-P0-AX |
5 |
250х21.2 |
00D-4442-U0-AX |
5 |
100х30 |
00F-4445-N0 |
10 |
150x10 |
00G-4445-N0 |
10 |
250x10 |
00F-4445-P0-AX |
10 |
150х21.2 |
00G-4445-P0-AX |
10 |
250х21.2 |
00F-4445-U0-AX |
10 |
150х30 |
00G-4445-V0-AX |
10 |
250х50 | Система защиты колонок SecurityGuard
Номер по каталогу Phenomenex |
Описание |
Размер, мм |
Рекомендуется для колонок с внутренним диаметром, мм |
KJ0-4282 |
Security Guard Kit, включающий держатель картриджа 2-3 мм ID |
- |
2-8 |
AJ0-9281 |
держатель картриджа 10 мм ID |
- |
9-16 |
AJ0-8223 |
держатель картриджа 21.2 мм ID |
- |
18-29 |
AJ0-8277 |
держатель картриджа 30 мм ID |
- |
30-49 |
AJ0-8134 |
защитный картридж |
4x2,0 |
2-3 |
AJ0-8135 |
защитный картридж |
4x3,0 |
3.2-8 |
AJ0-8136 |
защитный картридж |
10x10 |
9-16 |
AJ0-8210 |
защитный картридж |
15x21.2 |
18-29 |
AJ0-8310 |
защитный картридж |
15x30 |
30-49 |
|
|